男女婴由于解剖上的不同，最终形成的瘘在临床表现上有性别上的差异：

　　1、普通肛瘘，最多见，男女孩均可发病。瘘外口(俗称瘘眼)多位于肛门两侧，一般距肛门口1-2cm。瘘外口较小，有时仅为—小圆形疤痕，略凹陷或呈一小丘状，局部皮肤有时色暗，瘘外口处常有少量脓性的分泌物，除腹泻时见不到粪渣。肛查时瘘内口大多触不清，但自外瘘口插入探针可深入至直肠腔。

　　2、主要见于男孩的肛瘘

　　①直肠会阴瘘，不多见，外瘘口位于会阴部位。

　　②直肠尿道瘘，罕见。仅见于男孩，肛门周围无瘘眼，但从尿道外口有时排出粪便及排气，常合并泌尿系感染症状。一般须经造影或CT检查确诊。

　　3、只见于女孩的肛瘘

　　①直肠大阴唇瘘，较多见。瘘口多位于大阴唇下方与小阴唇交界处。瘘口有时较大，但除病儿腹泻时很少有粪便溢出。

　　②直肠前庭瘘，多见，有人称作直肠舟状窝瘘。为和先天性无肛合并瘘时区别。而冠以直肠舟状窝瘘H型(下述的阴道瘘与此相同)的名称。瘘口位于舟状窝或阴道前庭，瘘口较大，但局部粘膜完整，很少有炎症反应，自瘘口常排出粪便。

　　③直肠阴道瘘，少见，瘘口多位于阴道下段或阴道开口处，称低位直肠阴道瘘;少数位于阴道中上段，又称高位直肠阴道瘘。无论低位还是高位，由于瘘口位置较隐蔽，常观察不清，须经造影或插管加以确诊。

　　不论性别如何，肛瘘容易反复发生感染，导致患处红肿流脓；平素患处有脓性分泌物或溢粪，常弄脏裤子和被单，并有难闻的气味，所以肛瘘应该治疗。值得庆幸的是，小儿肛瘘大多数是简单瘘，使得治疗相对容易些。